陳衷紀來到那霸港後，立刻穩定了商館的局勢，安定了人心.同時他立刻展開反擊，連夜派出特種營的捉生手偷入薩摩藩武士駐地，在樺山高明臥室枕邊留下一封警告信。此後，薩摩藩武士偃旗息鼓，停止了對中華商館的騷擾。
陳衷紀上岸後，通過原掌櫃陸雲的關係，首先去拜訪了琉球國文官階層的最高官員三司官謝名親方，向他建議由中華商館來幫助琉球人備戰。
大明洪武二十五年(1392年)，明太祖“更賜閩人三十六姓”。《中山世鑑》記稱“爲綱紀之役”，而《中山世譜》則稱，從此琉球“始節音樂、制禮法，改變番俗，而致文教同風之盛”。這些“三十六姓”福建人的後裔中，鄭迵（謝名親方利山）是其中一位最傑出的人物。
當年的“閩人三十六姓”來到琉球後，以那霸的久米村作爲居住地點，其使命最初是向琉球人傳授造船、航海技術，而後則必然地承擔了琉球對外文書工作，那霸作爲中國文化的窗口，不久便佔據了獨自的地位。這些華人後裔通事，累升爲長吏、大夫者也不少。
鄭迵是福建長樂移民的後裔。1540年出生於琉球國久米村，其父鄭祿任通事一職。他16歲作爲官生前往明朝，入學國子監達六年之久，歸國後任職於琉球國朝廷，負責管理嚮明朝朝貢的事務，其封地在浦添間切謝名村地頭，按琉球人的習慣被稱作“謝名親方利山”。1579年隨馬良弼赴明朝朝貢。1606年，57歲的鄭迥被任命爲三司官，成爲琉球歷史上第一位擁有中國血統的三司官。
1591年，薩摩藩島津義弘致書尚寧王，以豐臣秀吉欲出兵朝鮮爲名，命令琉球在明年二月前，將7500人十個月的糧食運至薩摩藩的坊津，然後設法運往朝鮮。鄭迥認爲這是十分無理的要求，主張強硬的拒絕這一要求；並且遣使嚮明朝報告，稱日本欲從朝鮮入侵中國。1598年，琉球的進貢船遇風漂至日本仙臺，德川家康遣返了船隻，要求琉球遣使向日本謝恩，又遭鄭迥拒絕。
如今的琉球中山王號稱尚寧王，是萬曆三十四年（1600年）由大明朝廷冊封的，明朝的冊封使者是給事中夏子陽、行人王士禎。他對於謝名親方非常信任，但是，他也畏懼倭國薩摩藩的威脅。
在尚寧王的概念中，中國人都是商人、通事、工匠；大明朝廷遠在天邊，除了能在法律上保障他的合法王位外，基本上是不會干涉內政的。如果要和中華商館合作對抗倭寇，那麼，中國人勢必要藉此機會深入到琉球國的內政中去。
琉球國曆代國王雖然非常崇拜中國文化，但是自己家的王位和王室的利益始終是佔了第一位的。
這個時代的琉球，進入王國時代纔不到300年。琉球羣島各地在宋朝時出現了地方部落統治者-“按司”，多是村落或部落的主宰者“根人”演變過來的。他們所以能夠擴大統治範圍，除了社會生產的需要而外，似與掌握先進的生產工具，控制必要的水源，以及相互征戰有關。沖繩島上的衆多按司領地通過不斷的爭鬥兼併，到宋朝和元朝時期最終出現了能夠統治其他按司的大按司，比如本島北部的今歸仁按司，島南部的島添大裏按司，以及位於島中南部的浦添按司(即《中山世鑑》裏記述的什麼舜天、英祖等君主)。這些大按司被稱爲“世主”，其領地在元末明初時發展爲山北(首都在今歸仁城)、山南(島民大裏城)和中山(浦添城)三個王國，琉球真正的王國時代在這時纔來臨。
三國爭相向大陸上的大明朝廷朝貢，並聲稱自己是琉球正統，彼此之間爭鬥不休，這就是所謂“三山時代’。其中山北國面積雖大，但地形崎嶇，土地貧疥，山南國則面積太小，只有中山國人口財富最多，國力最強盛。1406年，山南國佐敷地方的按司巴志起兵，推翻了沉迷酒色的中山國武寧王，隨後嚮明國的永樂皇帝請求冊封其父思紹爲中山王，1421年自己即位國王。明朝宣德五年(1430年)，明宣宗賜中山王“尚”姓，因此史書中將他們寫作尚巴志、尚思紹，這就是琉球王國第一尚氏王朝的來歷。
尚巴志掌權後，在1416年消滅了山北國、派次子尚忠爲山北監守。又在1429年擊敗了山南王他魯梅，統一了三山。他把王宮從浦添城遷移到首裏城，還修整了那霸港，使其成爲與中國、日本、朝鮮及南洋貿易的樞紐港，爲琉球國的繁榮莫定了基礎。不過，當時各地方按司的勢力仍然很強大，因此在尚巴志死後.政治上一直不穩定。琉球國號稱統一，但各地的按司仍然住在本鄉，擁有私兵和武裝。儼然是世襲的諸侯領主，只是名義上臣服於中山王。
尚真王是琉球國第二尚氏王朝第三代國王、第九代琉球國王，1477年（成化十三年）至1526年（嘉靖五年）在位。他是第二尚氏王朝第一代國王尚圓王之子。童名真加戶樽金，神號於義也嘉茂慧。
尚真王治世期間.最終奠定了琉球王國作爲統一國家的政治體制。他按照中國製度，將百官分爲正從九品，地位最高的是王弟、王叔、國相(攝政)，居幹都城者稱爲“某地王子”，派駐外地鎮撫者則稱“某地按司“。次一等爲正一品到從二品的官員、包括三法司(相當於宰相)、表十五人(相當於大臣)，以及物奉行所(分爲用意方、給地方、所帶方三座官廳，負責度支、貿易、國庫出納、保管國有時產)和申口方(包括平等方、泊地頭、雙紙庫理、鎖之側四座官廳分別掌蒼司法、戶籍、外交、港口事務，文教、營造等職)的負責人，被稱爲“某地親方，或“紫巾官；正三品以下爲“黃帽官”，稱爲“親雲上“，八品以下爲“紅帽官“.稱爲“某裏之子”或“某地裏主親方”。三品以下黃帽官，皆稱某地親雲上。未有地方者，稱某裏之子親雲上，或稱某築登之親雲上。從六品，敘德郎，從七品，敘功郎，皆稱某捉(相當於一村或幾個村構成的地方機構“間切”)親雲上。八品紅帽官，稱某裏之子，領地方者，稱某地裏主。九品紅帽官，稱築登之，未入流稱某子，皆不稱姓名。
尚真王一改舊制，在1526年解除了各地按司的兵權，把他們全部強制集中到都城首裏的“首裏親國”街區來居住，同時收繳各地領主的刀劍弓矢等兵器，將其集中存放於首裏.這種法王路易十四式的做法雖然削弱了地方諸侯的力最，強化了中央集權，但是按司不再領兵作戰，此後琉球國內唯一擁有戰鬥力的常備軍就只有王宮衛隊。雖然這支衛隊一直保持很高的戰鬥力，曾經參與明朝剿滅俊寇的戰鬥。但由幹軍隊數太少，僅僅千把人，根本不能抵擋日本的全面入侵，在即將到來的倭寇侵略戰爭中，琉球王國將爲此嚐到苦果。
但是，尚寧王等琉球統治者依舊對明朝懷有幻想，希望明朝能夠出面壓服倭人。他不喜歡和中華公司合作；雖然中華公司已經是琉球最大的貿易伙伴了，但是琉球國王對大航海時代的東**況是不太瞭解的；雖然他聽說中華公司打敗了西班牙人，佔領了呂宋島；而且，中華公司基本壟斷了中國到日本的海上通道，順便也給琉球帶來了大量貿易機會。但是，中華公司終久是武裝的海商團體，而大明帝國朝廷依舊是正統，也是他的主子。他希望明朝朝廷能壓制倭人，但是明朝的軍隊最好不要來琉球，當然自己的王位和權力不會失去纔是最重要的。和中國海商合作，畢竟是言不正名不順的。琉球雖然靠經商致富，但是卻繼承了明朝的文化傳統，商人地位不高。實際上，琉球的海外貿易都是王室壟斷經營的，本國商人是根本沒什麼機會參與的。