終於有一天，和他們相依爲命的小狗死了，而後他們開始追尋木葉三忍。準備好能夠長期攜帶的食物，將黃狗安葬後，三個孩子揹着包裹，踏上了漫長的拜師之旅。在出發之前，彌彥把那些偷來的但又無法帶走的食物，還給了那些被偷的村民。
可是，追尋木葉三忍絕不是簡單的事情，這對三個孩子來說，就是不斷地深入戰場，不停地彷徨迷惘。有一次彌彥不知道從哪裏找來了防毒面具，三個孩子戴着防毒面具，冒險進入了有毒的霧區。彌彥的謹慎小心，避過了陷阱，救了他們多次。雖然沒有找到三忍，但彌彥撿回來一把苦無，拿在手裏耍帥。
看到長門和小南有些消沉，彌彥不斷地鼓舞，終於讓二人露出笑容。如果沒有彌彥，長門和小南恐怕早就放棄了。然而忍者是不會輕易留下自己的行動痕跡的，木葉三忍更加是難以找到。可是彌彥沒有放棄，在他的堅持下，三個孩子更加地深入戰場了。
彌彥認爲，越是戰鬥激烈的戰場，三忍活躍的可能性越高。有一次，三人經過峽谷，冒險攀上了一個高崖。彌彥把小南拉上來後，遠處的爆炸聲漸漸停息了，彌彥警覺這裏的情況不對勁。瀰漫天空的苦無、手裏劍、起爆符像下雨一樣落下來，三個孩子不湊巧地處在了戰場的中心。
危急關頭，長門打開了輪迴眼，形成了一個斥力防護罩，擋住了所有的攻擊。但是三人腳下的高崖卻被起爆符炸燬了，三人向下墜落，掉入了峽谷的河流中。幸好三人出身雨之國，都熟悉水性，總算撿了條小命。命運之神開了個玩笑，彌彥三人掙扎上岸後，剛巧遇上了從這裏經過的木葉三忍。他們終於找到了自來也，那位來自妙木山的蛤蟆仙人。
看見木葉三忍在那裏休息，彌彥壯着膽子走過去，與自來也等人談話。但是長門無法接受木葉忍者，原因是父母之死。在大雨中，三忍即將離去，彌彥提出了想要學習忍術，小南把紙花遞給綱手。大蛇丸心性陰冷，“殺掉這些小鬼吧！我看過太多的戰爭孤兒，都非常悽慘乾脆在這裏殺掉他們，也是爲了這些孩子，對他們來說也是一種幸福”
這種離譜的提議，自然被自來也和綱手否決。自來也讓大蛇丸和綱手先回去，“我留下來暫時照顧一下這些孩子，起碼等到他們能夠自立爲止。權當作對這個飽受戰火國家的補償。”
歷盡艱辛長門、小南和彌彥終於和自來也相遇了，自來也決定留下來照顧他們。長門對木葉忍者芥蒂很深，但自來也給人的感覺與衆不同。這樣就開始了師徒4人的生活。
不久之後發生了一件事情。巖忍的餘黨來襲擊了彌彥和長門，在彌彥即將被殺掉的瞬間，長門用輪迴眼的力量殺掉了那個巖忍，而且是無意識的。隨後，自來也和小南趕到這裏，自來也發現長門有一種特殊的力量，那就是名爲輪迴眼的瞳術。這件事之後，本來一直疏於教導他們忍者修行的自來也，開始認真傳授三人忍術。
雖然自來也說那是爲了防身的忍術，但對長門來說，那是爲了能讓他控制輪迴眼的力量。但長門害怕這種力量，仇恨在讓力量失控。長門認爲自己做錯了事情，罪惡感一直責備着他。但是自來也從低谷中拯救了他，告訴他力量也許會傷害人，但也能拯救別人，彌彥就因此逃過一劫。“你保護了朋友，你做的應該是正確的事情。誰也沒有權利來責備你”等長門回過神來，他發現自己已經在不知不覺中認同了自來也老師。
自來也說，“受到傷害會記住仇恨，傷害了別人會遭到憎恨但是當體會了這種痛楚之後，才能真正地善待他人。人們是在體會痛楚之後，纔會成長的。成長之後要怎麼做，這就要自己去考慮了。體會痛楚，不斷地思考，得出怎樣的答案”自來也彷彿也是說給自己聽一樣，這樣教導長門，但是他自己也沒有找出答案。長門道，“就如同你現在一樣，鳴人。”
當時長門覺得自己找到了答案，“我只要保護兩個人，不管會伴隨着怎樣的痛苦。”自來也告訴長門，“這個忍者的世界充滿了仇恨，戰爭和憎恨到處蔓延我在想着如何消除它和平究竟是什麼，我想找到這個答案。”這之後過了3年，通過修行，3個孩子變成了少年，身心都有所成長。只是自來也的話一直留在長門心中翻滾，久久難以釋懷。
自來也把這個答案寄託在了長門的輪迴眼上，“很久以前，人們經常爭鬥，戰爭不斷，是比現在更加慘烈的時代。那個時代出現了一個僧侶，首次闡明瞭查克拉的真理，想將世界引向和平。傳說他走遍世界，傳播忍術絕學，宣傳自己的教義。忍術並非只包括武力，同時也是將人們引向和平的教誨。這位僧人就是六道仙人，是被冠以世界救世主的聖人，而他擁有的正是輪迴眼。[我乃維護安寧秩序之人]，這是六道仙人的格言。他堅信人們能夠真正相互理解的世界，終將到來。”
自來也認爲長門可能就是這位仙人的轉世，輪迴眼寄託着仙人的心願。三年後，自來也將和平的信念託付給了長門後離開了。
把和平的希望寄託給了長門和彌彥，自來也就離開了他們。彌彥不負衆望，成爲了大家的首領，不久將其發展壯大，並當上了這個龐大的組織的領袖，不依賴權利和武力去創造和平的想法很快得到了大家的支持，許多忍者加入了進去。這個組織就叫做曉，很快就名聲大振，大家都贊同構建一個不靠極端武力維持的和平世界。
但是，當時依然處於第二次忍界大戰期間，巖隱、木葉、砂隱三大忍村還在交戰中。雨隱的首領半藏，聽聞了這個組織，故意接近了彌彥等人。因爲半藏已經無法忽視彌彥等人的存在了。半藏提出以曉作爲主體，向三大國提出和平交涉的提案。
爲了達成這個和平協議，彌彥等人同意了半藏的建議，答應協助半藏實現雨之國的和平。但這一切不過是禍端的開始，彌彥等人在政治上還很幼稚。一切都是半藏的圈套和陷阱，他擔心雨隱的主導權被彌彥奪走，爲此處心積慮地要除去彌彥。
果然，在約好交涉的地點，包括木葉的暗部在內，半藏率精銳部下埋伏在那裏。半藏和木葉暗部的首領團藏勾結，想要將曉全部抹殺。團藏爲了爭奪火影的寶座，答應協助半藏。半藏爲了維護雨隱的統治，勾結了團藏。在長門眼裏，這兩個藏，就是狼狽爲奸沆瀣一氣。
半藏出其不意地抓住了小南，說出了自己的真實目的，以小南的性命爲要挾，逼彌彥自殺。半藏擲下苦無，讓長門用這把苦無殺死彌彥，“這樣的話，我就放你和這個女人逃走。”小南大驚，“住手啊，長門。別管我，你們兩個快掉逃走，回頭再給我報仇！”
彌彥見情況危急，命令長門用苦無殺死自己，以便救出小南。看到長門猶豫不決，彌彥抓住長門的手臂，把苦無刺入自己的身體，自盡而亡。臨終前，彌彥囑咐長門，“你和小南要一起好好活下去！你也許真的是這個世界的救世主一定可以的”