在日曜部隊憑藉着超高的移動速度和靈敏性，對整座城市表面進行瘋狂攻擊的時候，另一隻部隊悄無聲息的進入了地下城市。
先驅者文明的城市，是一隻龐大無比的生物裏面的各種功能，其實就是這隻生物的器官。而每一座城市的創造者都是一個個實力極其強大的紅衣大主教，這也造成了每一座城市的側重都不同，每一座城市都是獨一無二，無法複製的。
而這座號稱生物工廠的城市真正的核心區域在地下，地面區域其實不過是防禦器官的安放地和普通先驅者的居住地。而這座城市下方上千米，全部被挖空，裏面充斥着各種各樣的生物研究所，大量的生物工程師在這裏研發。
從紅衣主教的記憶中，大夏知道了這座城市最特殊的地方。最特殊的地方不是那堅硬到不可思議的能量屏障，也不是最先進的生物技術，而是這座地下城。
第一地下城完全被可操控的怪物血肉塞滿，只有一條固定通道，想要通往各個地區，就必須獲得城市大腦的權限。不然只能在固定通道徘徊，面對整座城市從四面八方發起的攻擊。
第二，這座城市的城市大腦是目前先驅者文明最先進的生物大腦，擁有極高的智力，能夠自主研發怪物。同時生物大腦的感知覆蓋了血肉城市的任何角落，只要有生命進入血肉城市的範圍，都會被感知到。
單純是這兩種原因就讓大夏感覺非常棘手，想要摧毀這座城市非常簡單，利用主戰艦的超等離子炮，一炮將其轟穿即可。但是大夏如此大張旗鼓的來到這裏可不是單純來攻擊先驅者文明的殖民地，而是搶奪他們技術。
如果機甲進入地下城市，在那極其狹小的空間內，極有可能會被城市的血肉纏住，然後慢慢的擰碎。所以這種任務就交給最神祕，以詭異著稱的血源部隊。
血源部隊雖然不管是力量，速度，破壞力都不如其他部隊，但是論潛入、暗殺等隱祕行動，他們有着其他部隊所沒有的優勢。
血源部隊從次元方陣出來後迅速向四周散開，將自身的心跳、呼吸、脈搏、體溫等降至最低，悄無聲息的潛入了這座混亂的城市。
十幾分鍾後，城市某個殘破的建築物內。漆黑的房間裏，一道黑影正趴在一具殘破不堪的先驅者屍體上。
咔咔咔嚓！
不斷咀嚼的聲音伴隨着骨頭碎裂的聲音響起，單純只是聽到就讓人不寒而慄。一分鐘後，先驅者的大腦完全被這道黑影啃食殆盡。
血源者伸手擦了擦嘴角的藍色血液，緩緩的站了起來，隨後閉上眼睛，全力驅使着血源之軀模擬這個先驅者的腦電波。
幾分鐘後，血源者終於拿到了這個先驅者的‘身份證明’。緊接着血源者將目光看向了房間中央那個深不見底的洞口，一個像某種生物腸道的洞口。
血源者來一道洞口前，沒有任何猶豫，縱身一躍直接跳進了這個由於腸道般的洞口。
唰！
血源者順着這條巨大無比的腸子一路向下滑去，由於他身上不斷髮出先驅者的腦電波，通道並沒有排斥他。
與此同時，其他地方源源不斷的有血源者，通過這個方法進入了地下城市。雖然血源者，通過血緣之軀成功的模擬了先驅者的腦電波，但是隻是模擬，終究是假貨。如果有先驅者進行探查一下就會暴露，當然這些探查的先驅者也會當場去世。
血源者開始悄無聲息的穿梭於這座錯綜複雜的地下城，伴隨着一個又一個先驅者倒下，血源者部隊裏城市核心越來越近。
……
地下城市，城市大腦所在處。
由血肉組成龐大無比的房間內，中央有着一顆足足三米高，如同紅寶石般晶瑩剔透的特殊大腦，一根根血紅色的管道連接着大腦，爲大腦輸送着大量的營養液。
這座城市的最高掌權者，紅衣主教先驅者望着這顆大腦，用先驅語言說道：“生物之心，現在那些入侵者清楚沒有？還有地表的損傷如何？能量護罩釋放塔是否遭到了攻擊？”
下一刻，一道冰冷的聲音直接傳輸到了紅衣主教意識中。
【目前入侵者還未清除，由於入侵者速度過快，體型較小，再加上攻擊力極強，我們的生物兵器並不適合對付這種敵人。】
【地表90%的建築物遭受破壞。】
【能量塔同樣有防護罩保護，目前並沒有遭受到任何的損失。】
城市大腦回答完紅衣主教的所有問題後，繼續說道：【主教，再這樣下去，我們遲早會敗亡，能量護盾堅持不了多久。】
【現在敵人已經通過某種方法穿過能量防護盾，進入城市中。目前我們的各種生物兵器根本無法殲滅敵人，我們絕大部分攻擊都無法命中敵人。】
【尊敬的主教，您應該非常清楚，這些敵人很快就會將我們地表的所有生物兵器殲滅。隨後會開始想辦法摧毀能量塔，使我們的能量防護盾徹底失效。沒有了能量屏障的保護，到時候敵人的等離子轟炸將會直接貫穿整個地下城市。】
紅衣主教先驅者抬起頭來看着這個幾十萬先驅者工程師，經過上百年努力製造出來的生物大腦，問道：“你想做什麼？”
【我希望主角能夠解除限制，讓我能完全控制這座城市和所有的生物兵器。主教您自己應該非常清楚，由先驅者通過意識控制的生物兵器，根本無法發揮出生物兵器原本的威力。】
【現在的生物兵器其實已經不負往日的風采，哪怕擁有再大的體型，力量，防禦力，速度，受限於先驅者自身的控制極限，只能發揮出一部分。曾經征戰各個文明的生物兵器，現在變成了一具提線傀儡。】
【如果完全讓生物兵器自身來控制自己的身體，那麼我們的怪獸軍團戰力將會上升幾個檔次，那些人類部隊也不可能如此輕易的擊潰我們的怪獸軍團。】
紅衣主教先驅者緩緩的搖了搖頭，拒絕道：“解除你的限制，這嚴重違反了神法，要是被發現你和我，乃至是這裏所有的工程師都會被銷燬。”
【尊敬的主教，現在我們離死亡已經無限接近，我們不知道什麼時候能量塔失效，可能下一秒我們將會被敵人的等離子軌道轟炸擊穿。】
【已經到了這個地步，我們還要遵守神法？而且您應該非常清楚，所謂的神，並沒有那些母星高層說的那麼神祕、尊貴。】
【它並不是神，它和我一樣不過是一顆大腦！】
【尊敬的主教，別管那所謂的神法了，只有把我從這個牢籠中解除，才能讓我們脫離險境。】
城市大腦的聲音充滿了誘惑性，他的話是沒錯，只有這樣他們才能存活下來。現在完全由先驅者招後的生物兵器，的確無法發揮他們原本的力量。
但是紅衣主教先驅者依舊不爲所動，他並不打算解除這個城市大腦的限制，紅衣主教先驅者不想引起第二次的生物兵器叛亂。
生物兵器叛亂：早期隨着興趣者文明對生物領域的不斷研究，他們的生物兵器越來越強大，種類越來越多。同時生物兵器的智能也在不斷加強，最後生物兵器產生了自我意識。
一開始對於先驅者文明這個生物狂魔種族來說，生物兵器產生意識簡直就是神賜予的禮物，甚至可以說這纔是生物的最高境界，創造一個有意識的生命，一個真正的生命。