不管申若愚在這裏依靠各種設備專心尋找上帝沉睡的庇護所，外界卻因爲申若愚替代了上帝的存在而產生了巨大的反應，並且因爲各種神話生物的頻頻出現導致了外界對於上帝和各種科學的懷疑，再加上申若愚闇地裏安排了許多人，將許多即將出現或者已經出現的一些著名科學家給祕密的通過各種手段帶回了自己的基地導致了科學發展的停滯，雖然這樣一來引起了一些國家的懷疑，但是在申若愚遠超這個時代的科技之下找不到任何的線索，而教皇保羅四世最近則很是意氣風發，因爲衆多天使的加盟導致了現在教廷的實力和信徒急劇膨脹。
各地都出現了大量的教堂，而且教廷內部的武裝勢力，包括裁判所和聖殿騎士團以及最新組建的直屬教皇的聖堂武士，在天使和申若愚提供的各種提升身體素質的基因藥劑的支持之下更是實力膨脹的厲害，這樣一來教廷在歐洲範圍內的話語權也越來越大，雖然一些國家也在暗中支持了許多組織與教廷對抗，但是卻因爲實力的差距太大最後都慘淡收場。
最後在英國女王的牽頭下聯合了法國和西班牙以及葡萄牙和意大利等受到教廷一些好處和條件的國家組成了支持教廷的神聖聯盟，而以美國和德國還有匈牙利還有加拿大等除神聖聯盟之外的國家則組成了反對教廷的真理聯盟。
於是兩個聯盟之間便開始了各種明爭暗鬥，但是因爲各種神話生物的作亂，真理聯盟很大的一部分實力都被這些生物給牽制住了。所以從一開始就處在了下風。並且由於各種原因和天使本身所代表的意義以及本身的實力。再加上這些國家內部許多人也都是信仰教廷的，所以內部也不得不允許各大教堂的繼續存在和天使的出現，只是在其強大的武力支持下暫時保持一種平穩而已。
而在天使聯盟內部，由於有申若愚的支持許多在各地“作亂”的惡魔和各種武力強大的神話生物，則在各種衆目睽睽之下不是被天使趕走就是被聖堂武士或者聖殿騎士團給一一消滅，因此教廷的聲望在民衆中的聲望變得越來越受歡迎，再加上教廷一改中世紀時期的各種強制傳教，轉而變得溫和許多。並在各地和一些偏遠貧窮的地方開辦了許多的神學院和武士學校，免費接收那些上不起學或者因爲各種狀況而變成孤兒的孩子開始從小培養，而且還開辦了許多的教會的醫院，免費爲那些交不起醫藥費的窮人看病，因此在神聖聯盟內部出現了極爲和諧的情況，兩相對比之下，再加上一些潛藏在真理聯盟內的特務進行的一些宣傳，真理聯盟內部的一些民衆紛紛通過各種手段和神聖聯盟特工的幫助下逃到了神聖聯盟內部，並且得到了十分妥善的接待和安排。
而那些被神聖聯盟“趕走”的神話生物則紛紛進入到了真理聯盟的內部，這下子真理聯盟原本就十分緊張的局勢和內部矛盾一時變得更加糟糕。一些小國家迫於民衆的壓力不得不暗中聯繫了神聖聯盟請求教廷派一些天使或者聖堂武士來消滅這些惡魔！
而美國，加拿大和德國等比較有實力的國家雖然也利用強大的武裝軍隊。殺死了一些不太厲害的惡魔和小怪物，但是自身受到的損失也是不小，而且憑藉着現在的武裝力量，一些特爲強大或者神祕的生物和惡魔根本就不懼怕現在的各種槍械和武器，在損失了無數的軍隊和特戰隊之後，在真理聯盟之內形成了許多被怪物霸佔的禁地，好在這些惡魔和怪物也並沒有無故的殘殺人類，這些實力突出的惡魔和怪物明顯在智力上也極爲出色，而在對抗中這些國家倒也出現了一些依附於真理聯盟擁有神奇力量的人士，雖然數量不多但是倒也勉強能夠保證一些重要城市的安全。
時間就在神聖聯盟和真理聯盟的明爭暗鬥中慢慢過去，不過爲了不爆發範圍過於廣大的戰爭，教皇保羅四世在申若愚的指示下並沒有採取過激的行動，而是採用蠶食的政策慢慢的對真理聯盟進行軟侵略。
三年之後，真理聯盟的成員只剩下了美國，加拿大以及德國三大國家，其他那些小國家則在這兩年裏紛紛投入到了神聖聯盟的懷抱。
這三年裏申若愚得到了教廷內部幾百年來的全部珍藏，其中確實有許多值得借鑑的東西和書籍，並且還找到了傳說中的死海文書，以及許多關於瑪雅文化和古華夏的各種文獻，再搭配上之前找到的亡靈黑經和太陽金經，申若愚在信仰之力的運用之上確實得到了長足的進步，並且初步解決了利用信仰之力不通過申若愚本身處理就將其返還給信徒形成各種神術的方法。
但是這一切的前提就是申若愚必須擁有神格，而因爲不想凝聚神格，害怕因此而被神格和信仰之力給限制住自己本身的發展以及未來，但是因爲許多事情和能力卻偏偏需要神格的幫助和處理，所以這三年申若愚在盤古的幫助下想到了一個代替神格的辦法，那就是盤古犧牲自己的大部分能力通過信仰之力的神奇作用進行洗刷，儘可能的縮小自己本身的體積，進而做了一個小手術放入到了他的大腦之內，使之與申若愚的神經進行連接，之後將所有的信仰之力全部凝結在盤古所化的芯片之上，以盤古爲核心，形成一個有自身處理能力的高科技神格！
這樣一來有盤古的存在，神格對於申若愚來說就成爲了一個功能強大的處理核心，並不需要任何事情都通過申若愚自身的處理，而且這樣一來即使將來信徒全部死去信仰崩潰，申若愚也不會因此而受到牽連，大不了將盤古的程序複製一下，轉移到一個新的超級處理核心之內就好了，至於因此而崩潰的神格，因爲並沒有依附在申若愚的靈魂之上，到時候崩潰的就只可能是神格本身，到時候申若愚只要再在一些世界內重新佈下信仰就可以再次依靠盤古凝結新的神格了！
再說申若愚本身就擁有一個世界，這個世界內的全部生物都是申若愚的天生信徒，而且還都是狂信徒，信仰基本上不可能崩潰，這樣做只是申若愚處於自身過於謹慎的性格而已！
而完全忠於申若愚，又曾經吸收了火種源的盤古在制定了這個計劃之後，就盡全力製造了一個替代自己的高智能智腦代替自己的日常管理和各種工作，然後就全身心地投入到了這項芯片神格的準備工作之中，而經過近乎一年的信仰之力沖刷，盤古本身所化的芯片基本上已經處於了一種物質和能量體之間的一種神奇物質，而曾經吸收的火種能量不但可以叫申若愚得到類似於人類這種碳基因生物的信仰，就連變形金剛這種硅基生命的信仰之力也一樣能夠接收，這樣一來申若愚的信仰傳播範圍可就大了一倍，而且他還能通過盤古依靠硅基生命的信仰之力逐步提高變形金剛的智能和能力，也算是一大收穫吧！
於是在四年後的某一天，教皇宣告再次收到神諭，得到了只要信仰虔誠，然後通過教廷內部教導的手勢和語言就能放出一部分神術，其中最爲著名的就是聖療等一些作用廣泛的治療技能！