尹峯明確了將正式建立政府機構，在場的衆人立刻明白了他的意思：這就是說，中華聯合公司正式走出了建立一個國家的第一步.
曾棋站起來說道：“我們大家的目的是一致的，我們辛苦打下的江山，賺下的萬貫家財，沒理由拱手交給朝廷那幫子只會鬧黨爭、貪污受賄、讀死書的書呆子的。古人雲蛇無頭不行，無論是鎮守府還是公司，我們都得有一個頭領，我想這個頭領只能是尹大東家，大家沒有異議吧？”
大傢伙都把頭搖得象撥lang鼓，一致地說：“尹大東家就是我們的領頭人”
通過這一次會議，尹峯將公司對佔領區地方行政管理部分的決定權基本上掌握在了自己一個人手中，不再需要走董事會的形式了。
同時，他還在德川家康身上賺了一大筆錢：德川家康終於在上一年年底開始了消滅豐臣氏的大阪之戰。尹峯乘機提高價格，把賣給幕府的大炮提高了五倍價格。同時，他也偷偷地賣給豐臣家一些小型火炮和火繩槍，價格也是不菲。
尹峯在幕府和豐臣家兩方總共賺了百萬兩白銀，而且，這些錢是中華軍出面賺下得，完全可以有尹峯一人來支配。
手頭有了餘錢，不需要公司董事會的同意，他立刻開始對中華聯合公司進行機構大改組，將要成立臺灣、呂宋兩個鎮守府，同時在呂宋下設五個縣，臺灣設立四個縣（臺北、臺中、臺南、臺東），琉球和西婆羅洲各成立一個縣，其餘南洋殖民地依舊是由公司和中華軍實行軍事化管轄。
這樣，大量的公司商務部、商情部、農墾部人員就得轉爲政府行政人員。由於尹峯規定行政管理人員必須在自己管轄區最起碼連續待三年，這對那些在公司有大量股份、精於生意之道的夥計和職員非常不利，因此很多人選擇繼續待在公司內任職幹活。
這樣，在中華公司統治區，出現了地方行政官吏缺乏的現象。
萬曆四十三年五月，中華聯合公司通過自己的商業網絡和在商業政治上的人脈，向整個明朝統治區發出了一個信息：臺灣即將公開招考官吏了。
這簡直就是公然造反之舉，但是卻真的有不少讀書人去了臺灣參加考試。
明朝科舉考試使得所有讀書人要想得到出路就只有做官這麼唯一一條路。整個中國，似乎除了做官，就沒有其他值得讀書的目標了。因此，那些久考不中的童生、無法進學家境困頓的書生，那些手無縛雞之力除了讀書一無所長的書呆子們，真的從各地陸陸續續趕來了一百號人，他們都想着在臺灣做個官也是好的：至少，這裏名義上還是大明屬地，而且聽說在此地做官不用刮地皮也能拿到高薪。
尹峯把如何招考這些讀書人、以及如何把他們培訓成爲中華公司體制下的行政幹部等等麻煩事全交給了曾老爺子和曾山。他自己來到水軍軍港魍港，爲出徵廣東的葉華送行。
福建沿海已經不存在任何海盜海匪了，幾百處海灣已經成爲了中華聯合公司控制下的海港。而在浙江和廣東沿海，還有一些不屬於中華聯合公司的海上武裝存在。
浙江沿海的舟山羣島和臺州外海的三蒜島、溫州外海的南麂列島等地，明朝初年都有一些居民常住。洪武年間開始禁海，湯和巡海後將這些外海島嶼居民強行遷入內地，甚至只給一天限期，否則就充軍流放，導致幾萬島民拋家棄產、連船隻都來不及準備，劃着門板做的木筏渡海遷往內地，餓死淹死無數民衆。這些島嶼因此就成了無人荒島，後來就成了倭寇和海盜們的樂土。
眼下這些島上還有一些小打小鬧的海盜武裝，靠走私一些貨物給中華公司過活，或者就是打劫一下沒有懸掛中華聯合公司藍底中字旗的商船。
對於這些小股海盜武裝，尹峯只是派出了飛龍號主力艦帶着十艘三桅炮艦，在浙江沿海巡遊一番後，召集了那些小股武裝勢力的頭目在三蒜島上集會。
三蒜島後世人稱海盜島，不知它究竟是因島型似蒜而得名，還是舊時島上長滿胡蒜，漁家常取之爲食而得名。這小島地形險要，海島周邊暗礁叢生，島中天然洞穴貫穿，向來是浙江沿海海盜聚會之處。這一次來到三蒜島聚會的海盜幫派大約有十幾股，基本上包括了浙江沿海的所有海盜幫派。嘉靖大倭寇時期，浙江沿海海盜勢力遭受重大打擊，再也出不了王直這樣的梟雄人物了，從此一蹶不振。來到島上的海盜團伙雖然有十幾股，但是所代表的海盜總數不超過2000。
飛龍號龐大的身軀在一羣小帆船之中顯得非常不協調。陳衷紀作爲尹峯的全權代表，正在從飛龍號上攀着繩網下到海面上的擺渡小艇上去。三蒜島海岸邊地勢陡峭，不用小艇根本無法靠岸，而這種小艇是當地海盜常用的搖櫓木船，可以在礁石險灘間來回穿梭，躲避官兵水師的追捕，當地人叫“咕嘎船”。
爲什麼叫這個名字？陳衷紀問了一下當地水手：一說是“過街船”的諧音。理由是，海上如同陸地，也有船兒行走的街巷。跨海擺渡，可不就是過街。
一說是“咕嘎船”。擺渡的小船兒，都是搖櫓的木質船。木櫓一搖，“咕嘎”作響，漁民們便簡稱之爲“咕嘎船”。“咕嘎”，“咕嘎”，陳衷紀覺得叫“咕嘎船”更有意思。
陳衷紀在一百名水手火槍隊員的簇擁下，劃着十幾條“咕嘎船”登上了島。早有幾名皮膚黝黑的漁民在此迎候，說是請中華公司的大爺去礫石灘開會。走了一段山路，然後沿一條石子堆積的小路而下，穿過一條形如“一線天”的巖塹狹道，即進入礫石灘。灘面積不大，但周圍危巖怒礁，礁巖間顯露洞穴，海景開闊，波lang掠灘，灘聲鳴鳴。礫石灘面對着的就是一望無際的東海海面，而開會的各路海盜頭目就在巖石洞中等着陳衷紀。
“什麼叫收編？”
“你們這是以大欺小，不給我們活路！”
“尹船主在哪裏？我們要找他說話！你們總得給我們一頓飯喫啊！”
“別他媽仗着船大炮大就欺負人！大不了我們去投官兵！”
陳衷紀剛剛說完自己的來意，這十幾股海盜頭目就鬧翻了天，亂哄哄地叫着。
這個巖洞在漲潮時會被海水淹沒大半，大白天也得用火把照明，此時陳衷紀腳下依舊是被海水沖刷着。他冷冷地在火把光線下看着這些浙江海盜的反應，面無表情地靠在一塊礁石上。
漸漸地人聲低落下來，大家都看着陳衷紀，這位中華聯合公司的年輕人。
陳衷紀站起身，拱手轉了一圈，大聲道：“諸位都是在海上討生活這一行的前輩，小子奉命前來收編諸位的隊伍，本來就沒打算動粗。只要諸位加入中華聯合公司，一切都好談；否則，我也愛莫能助。並非我中華公司持強凌弱，而是我家船主大人本着仁義之心，爲大家着想。”他緩步走到浙江沿海一帶最大的一幫海盜頭目面前：“臺州林巖石林老大，你和我家船主已經做了八年的交易了，你運出陸地的貨，我家船主何嘗少給過你一兩銀子？”
陳衷紀不待林老大說話，又走到另一名海盜頭目面前說：“這位前輩是海上蛟張大哥吧？我們公司的魯石頭魯大哥託我給您問好。你家侄兒被官府抓去，是我們通過寧紹參將羅慶的關係把他救出來的，對吧？”