水手火槍隊副統領林水生帶着主力部隊向井裏汶急進，救援被困在那裏的華人.這時，中華公司水軍艦隊方面的人員，還不知道李麗華的行蹤。三寶壟堡壘逃出來的荷蘭人沿着海岸線向西逃跑，打算和巴達維亞的荷蘭軍隊會合。井裏汶地區就擋在他們的去路上。
葉華和林水生、情報主管安小四商量之後，南洋特遣艦隊派出十艘快船去東南西北各個方向搜尋荷蘭艦隊的主力；中國艦隊的目標依舊是找到荷蘭艦隊主力尋求決戰。
三寶壟的荷蘭軍殘餘士兵中途和馬達蘭叛軍匯合了，現任國王帕庫布沃諾的三弟是叛軍首領。他的部隊組成中，有100多名荷蘭炮兵，還包括了一隊馬都拉士兵，大約有3000餘人-這是三王子向荷蘭東印度公司和馬都拉國割讓土地所得到的報酬。
人數總計有20000以上的馬達蘭叛軍、荷蘭、馬都拉三方聯軍，正在逼近井裏汶的中華公司甘蔗莊園。
200名三寶壟荷蘭守軍撤退到井裏汶時，只剩下150多人了，正好遇到三方聯軍對井裏汶發起攻擊。
尾追的中華軍水手火槍隊並未去救援井裏汶，而是向井裏汶以西的中華甘蔗莊園進發。在他們來到井裏汶地區的前一天早晨，中荷海軍主力部隊在井裏汶外海不期而遇。
於是，這個時代，這個地區，東西方兩支最強大的海軍爆發了爪哇海海戰。
在海灘邊，本來打算搭乘海星號離開爪哇島的李麗華一行人，目睹了這一場海戰。海星號無法偷闖荷蘭人戰艦陣列，只好在外海遊弋。
葉華的艦隊本來從三寶壟出發，西行搜索荷蘭艦隊。在井裏汶外海遇到荷蘭艦隊主力，他們也感覺很突然，但更多的是喜出望外：中國人此刻最希望的就是來場決戰，早點打完早點返回馬尼拉，西班牙人即將來了.
海軍上將喬裏斯.斯皮爾伯根的艦隊，包括歐洲來的船隻、原先的巴達維亞艦隊在內，本來有五艘主力戰列艦，另外還有十一艘快船，八艘輔助船，水手和士兵3000人左右，還有當地爪哇土著輔助兵數百名。
中華公司南洋特遣艦隊襲擊巴達維亞時，把鹿特丹號戰列艦打成了垃圾，另外有一艘荷蘭戰列艦去了馬六甲，因此，兩軍在主力戰艦的數量上已經失去平衡，中華軍飛字號五艘主力戰艦幾乎毫髮無損地出現在海面上,而荷蘭艦隊只有三艘戰列艦，在其他戰船數量上都處於劣勢，不過荷蘭人的中型戰艦-快船一類的戰艦裝備大炮的數量，卻是超過了中國艦隊同一類型的炮艦的。原先打算攻打井裏汶的荷蘭海軍上將喬裏斯.斯皮爾伯對中國艦隊實力並不瞭解，對於西班牙、葡萄牙人遠東遊記中關於中國海軍船隻的說法，他是非常相信的。
因此海軍上將喬裏斯.斯皮爾伯根也希望來一次決戰，徹底解決中華公司問題。
兩軍很快排列成陣列，荷蘭艦隊由西向東運動、中國艦隊由東向西機動，都是用船體一面側舷對着對方，準備用船舷排列整齊的炮窗中的大炮轟擊對方。這是標準的風帆戰艦時代的陣列線對轟戰術。此時的風向是吹向北方，對靠近海岸線佈陣的荷蘭艦隊稍微有利一點。
中華公司艦隊在組建初期，荷蘭軍教官室出了很大力的，因此兩支艦隊的水手、炮手們都是同樣訓練有素、紀律嚴明，而且基本戰術動作都是一樣的。
兩隻艦隊相隔一裏左右用陣列線對轟，中華軍擁有的霹靂火箭在射程上有優勢，但是準頭奇差，因此兩軍主要還是靠船側的大炮對轟。
兩隻艦隊上千門大炮轟鳴，硝煙瀰漫，海水沸騰，無數發炮彈在兩軍陣前你來我往。無數的中國與荷蘭的水手、炮手以專業精神、戰士的勇氣和智慧，在彈片飛舞的上甲板上奔忙、在炮艙內嗆人的硝煙中開炮。
兩支艦隊有一陣子打得勢均力敵，觀戰的李麗華等人幾乎以爲兩軍就此會永遠這樣轟來轟去，沒完沒了。
從早上到中午，中華公司艦隊有一艘福船炮艦被擊沉，數艘小型輔助船被擊毀。戰爭在鑄造生死與共的熱情和獻身精神的同時，也在鑄造冷漠、殘酷和野性，二者是統一的，統一於戰勝敵人的目的。葉華率領的南洋特遣艦隊全體打出了真火，乘着中午時風向轉爲北風，全體開始了衝鋒，原先排列整齊的陣列線頓時亂了。
但是，中華艦隊雖然放棄了陣列線戰術，但是並未陷入混亂，而是以一艘主力艦帶上五艘中國帆船，用主桅杆頂部的旗語、船尾的金鼓作爲通訊聯絡工具，分成五隊冒着敵方密集的炮火衝鋒。
很快，中國艦隊逼近了荷蘭艦隊的陣列線，在兩百步距離開始釋放霹靂火箭。
荷蘭人爲了躲避那些漫天飛舞的火箭，只好也打散了陣列線。就這樣，開戰兩個小時後，雙方都沒有重要戰艦被重創，但是卻幾乎同時打亂整列線，開始了混戰。
這一下，尹峯“發明”的小隊海戰戰術、艉射戰術終於可以發揮作用了。
荷蘭人非常不適應中國人的這種近戰戰術：這一方面是訓練水平的體現，同時也是兩國海軍對於海戰戰術理解不同的結果。尹峯教導他的艦隊重視對於戰艦船體的攻擊，目的在於摧毀敵艦的航行能力，並最終使其船體破損沉沒。而荷蘭海軍則重視對於敵艦帆桅的攻擊，目的在於殺傷對方艙麪人員和降低其機動能力，然後最終擊沉或者跳幫奪取對方戰艦。
中國人的陣列線散開後，大量小型船隻發揮了作用，從荷蘭艦隊的兩翼開始了迂迴包抄行動，戰鬥的天平在向中國人方向傾斜。
每艘中華公司艦隊都在船頭裝備號稱“粉碎機”的重型大炮，是專門設計來破壞船板的，威力巨大。最大的飛虎號有三層甲板，密佈着炮窗；還有甲板上的幾十具佛郎機，用來抗擊敵人的近距離跳幫進攻。
而荷蘭人的戰列艦，按照大小分爲一層，兩層，三層，甚至四層戰艦，每層兩舷是走廊樣的火炮甲板，安放排成長列的大炮，中間則是交通通道。戰艦兩側是十至幾十英寸的木質船板，雙方接舷作戰時很難打穿，即便打穿，實心的炮彈也只能洞穿一個窟窿，殺傷力有限。
戰艦裝甲最脆弱的部分則是艦首艦尾，因爲排成戰列的時候，艦首艦尾面對的都是友艦，無需特別的保護。遺憾的是天算不如人算，荷蘭戰艦的設計師沒想到尹峯會搞出這種艉射戰術：主動打亂自己一方的陣列線，突破進對方的陣型內進行攻擊。
中國戰艦繞到敵艦尾後，用船頭穿甲彈猛轟對方脆弱的艉樓，然後對準炸開的窟窿，向敵艦內發射噴射式的霰彈。由於當時歐洲風帆戰艦內部從頭到尾沒有隔板，這樣發射的霰彈可以從艦尾一直打到艦首，在整層甲板上造成屠殺般的殺傷效果。
這樣一來，荷蘭軍的人員損失直線上升，炮手死傷異常慘重。曾經逃脫了中華公司艦隊追擊的赫克託耳號戰列艦被兩艘飛字號首尾圍攻，互射兩個回合之後，赫克託耳號艙內人員傷亡達到了600人的驚人的數字，八成的炮手非死即傷，已經基本失去戰鬥能力了。