中華聯合公司或者說尹峯對於南洋開發的目的很明確，就是要控制和發展廣大的南洋各地.這是中國人首次有組織地在武裝力量保護下移民開發這一地區。
中國人不再是以前那樣零零散散地以單獨的個人前往南洋，也不再是受了委屈忍辱負重的好脾氣的中國商人。現在的中華公司是打敗了老牌殖民者西班牙人的新興力量，公司上下自信心正在高漲。
針對小土邦的挑釁，中華公司也不客氣，立刻出動了三百名護衛隊戰士，在友好的土著部落協助下，跋山涉水深入熱帶叢林，聯手附近幾個部落的土著友軍一舉將惹事的土邦滅國。
戴雅克人在1608年年初襲擊了中華公司的一隊金礦勘察人員，其中有一名充任工程師的多明我會傳教士被殺死。麥小六此時已經從菲律賓返回南洋，重新擔任了中華公司軍情部南洋總管；同時，他也是中華公司安全部南洋地區總管。他聞訊立刻出動了南崖州的護衛隊，兩個哨隊五百名戰士，外帶三門小型青銅炮，在招募來的一千多名土著輔助兵的協同下，對戴雅克人居住的原始森林地區發起了一次圍剿。
不曉得火器厲害的戴雅克獵頭族集中了幾十個村子的戰士，在一處河谷地帶正面挑戰中國人和土著的聯軍。結果可想而知，戴雅克人遭到了重大損失，有多個村子的男丁幾乎死絕。
如今，西婆羅洲（西加裏曼丹）的南崖州已經是中華聯合公司在婆羅洲的重要軍事據點。在海岸邊建立起了三座炮臺和方圓五裏見方的土木結構的柵欄牆。這裏也是西婆羅洲各處華人定居點和婆羅洲內地馬來人土邦的貿易中心，也是中華公司最大的黃金生產中心。
福建人多地少的社會經濟狀況使中華公司很容易就組織了大批移民出海。相比馬來羣島、印度尼西亞羣島的其他地區，西加裏曼丹地區的自然條件是比較惡劣的。但是中國人是最勤勞的民族，在短短兩年之內，因爲有中華公司以雄厚財力、物力、武力爲後盾，大約有兩萬華人有組織地移民來到了西婆羅洲。另外，還有一萬多自發來到這裏的沿海地區的中國百姓。兩年之內，這裏的黃金就很快成爲了中華聯合公司的重要收入之一。黃金礦的開採權大多是中華公司所有，不過中華公司也把部分地區的金礦開採權以許可證形式賣給其他商家。
在南洋的其他地區，由於荷蘭人和葡萄牙人比中華公司先到，佔據了一些關鍵的地點，因此在這樣的地方中國人傾向於和荷蘭人合作。在亞齊地區，荷蘭人很早就佔據了港口，中華公司的海盜原先佔據的亞齊東南部海港據點由於力量薄弱，後來被土著人奪回去了，荷蘭人實際只能控制一個港口。在馬尼拉戰役後，加強了武裝力量的中國人重返亞齊，和一支荷蘭艦隊合作，再次攻克了亞齊周邊地區；中華公司和荷蘭人瓜分了亞齊的土地；港口歸荷蘭人，周圍土地歸中國人。
荷蘭人來到亞洲，最先奪取馬魯古羣島的德那第、蘇門答臘島的亞齊等，1605年，荷蘭東印度公司把葡萄牙人驅逐出安波島並建立了要塞和商館，此後荷蘭東印度公司一心要專征服爪哇島，雅加達是他們的最主要目標。
早先居住在雅加達的華人有上千人，荷蘭人和中華公司簽訂合作協議後，用優厚的條件招攬中國商人來亞齊、爪哇做生意。華人和雅加達當地土邦的土著也有着良好的關係。在中華公司第一次澎湖戰役後，尹峯和荷蘭人合作愉快，進入了一段“蜜月期”。由於荷蘭人對於華人比較優待，因此，爪哇島上的華人移**動幫助荷蘭人攻打雅加達。
其中，居住在雅加達的華人海盜曾二蛟主動組織了華人輔助部隊，加入荷蘭軍隊中去，參加了進攻雅加達土邦的戰鬥。中華公司打着牌子進入爪哇地區還是前年的事情，尹峯號召福建沿海海盜幫南下之後，中華公司纔在此建立了商館。
1608年六月，在當地華人協助下，荷蘭人比另一歷史時空提前了十年佔領了雅加達，並將之改名爲巴達維亞作爲總督府正式駐地。
雅加達的佔領，很大一部分功勞得歸屬華人輔助軍。這些部隊有些是中華公司從護衛隊挑選出來的部隊，以哨隊爲單位參加荷蘭軍隊；尹峯這樣做是爲了鍛鍊自己部隊海外作戰能力，也是爲了讓自己的武裝力量熟悉巴達維亞的地理環境。
總督府正式成立的儀式上，荷蘭人任命的華人移民頭目“甲必旦”李錦、中華公司的商館代表等人就坐在了巴達維亞總督的身邊，幾千名華人移民在周圍歡呼着，舞龍燈、舞獅子等慶祝活動熱熱鬧鬧地展開。無數的土著人、荷蘭人移民都好奇地在圍觀。
剛剛從臺灣回來的範.萊頓已經是少校了，擔任了巴達維亞城防司令官。曾經出使過臺灣的達.尤該現在是巴達維亞總督，海軍上將麥特利夫是巴達維亞總督轄區的武裝力量總司令。
範.萊頓站在新建的炮臺上，看着成立歡樂的人羣，臉上卻是非常嚴肅表情。
在他身邊，正是他的上司海軍上將麥特利夫，東印度公司艦隊司令。這位紅髮大漢正撇着嘴看着中國人舞龍的隊伍經過前方。
“真是奇怪的民族，萊頓，他們的狂歡總是這麼喧鬧嗎？”
範.萊頓苦笑一下：“您沒看見嗎，這條異教的龍是他們最信奉的聖獸，我在福爾摩沙島時常常看到這樣的場景。”
麥特利夫搖搖頭：“我不認爲公司董事會的決議時明智的。你看，這裏有幾千的中國人，而我們荷蘭人只有三百多人。中華公司的本地區主管還能進入議會，這簡直就是在縱容中國人控制一切。我不知道巴達維亞真正的主人，到底是我們荷蘭人，還是這些中國人。”
範.萊頓嘆了一口氣說：“現在中華公司是我們在亞洲最大供貨商和經銷商，公司董事會絕對不會爲此和中華公司鬧翻的。”
麥特利夫冷笑：“利潤！是的，利潤！東印度公司爲什麼而被創立，不就是爲了賺錢嗎！可是，親愛的萊頓上校，你認爲這些中國人真的不會威脅到我們殖民地的安全嗎？”
萊頓踟躕了一會，遲疑不決地說：“將軍，以目前的局勢來看，應該不會。”
“什麼叫目前的形勢？少校，看看這些狂歡的中國人，這裏是我們攻打了六年的巴達維亞，可是這裏還能有什麼東西屬於荷蘭人？港口外都是中國商船，他們壟斷了貨物價格，賺取了東印度公司的大量硬通貨，我們到底得到了什麼？遠航幾千公裏運到歐洲賣出貨物後賺得勞務費嗎？”
範.萊頓苦笑了一下：“那樣也不少了，公司最近幾年的利潤都是成倍增加的。”
麥特利夫繼續冷笑：“哼！我將會在東印度公司年會上提出議案，爲防萬一，至少應該把中國人全都遷移到城外去居住。”
在巴達維亞城港口的一艘馬六甲商船上，袁進、李忠、李華宇等三人正在船頭看着人來人往的碼頭。
袁進用鄙夷不屑地口氣說道：“瞧，此處有一半的商船是中華公司的。尹峯這傢伙手可伸得真長。”